（一）辦公室（法制科、政策研究室）。負責局機關文電、會務、機要等日常政務運轉工作；承擔局機關文稿起草、政策研究、信息、新聞、檔案、安全保密、信訪、接待、車輛管理等工作；牽頭負責局政務公開和財政調研工作；承擔局機關及下屬事業單位的財務、資產管理工作；負責局機關離退休干部管理服務工作。
貫徹國家、省、市制定的各項財稅法律法規規章，組織、指導、協調財政系統依法行政和財政方面的法制工作；審核上報地方財政規范性文件草案、參與財政監督檢查項目的審理、擬定并組織實施財政行政執法責任制、財政法制宣傳教育，承擔國家賠償、行政復議、聽證和行政訴訟等相關工作。
(二)人事科。負責局機關和所屬單位的機構編制、干部人事管理工作；調查研究全區財政系統干部隊伍建設狀況；組織實施財政系統考核表彰活動；擬訂并組織實施區財政系統的干部教育、培訓規劃。
(三)預算科(稅政科、區非稅收入管理辦公室)。分析研究財政經濟形勢，擬訂財政支持經濟社會發展的政策措施；分析預算執行情況，研究提出財政政策、財政體制、預算管理制度的建議；組織編制年度預算及調整草案，匯總年度全區預算及調整草案，辦理預算調整事項；承擔區本級部門支出標準體系建設，擬訂區本級部門預算的政策規定，審定人員經費、公用經費支出標準和定額；負責稅務經費的管理；組織開展區級部門預算審核、匯總、批復工作；提出增收節支和平衡財政收支的政策措施與建議；負責區級預算指標的管理；承擔區財政與市財政結算、區對鎮財政轉移支付和結算工作。負責區級政府預決算的公開，牽頭組織部門預決算公開工作。
擬訂非稅收入政策并組織實施；承擔政府性基金和行政事業性收費項目維護；牽頭負責政府性基金目錄公開工作，參與行政事業性收費目錄公開；負責綜合性財政統計工作。
貫徹國家、省、市制定的各項財稅法律、法規、規章，在權限范圍內擬定具體的實施辦法；監督稅收法規和政策的執行情況；開展稅收調查分析，研究全區稅負水平。
(四)行政事業財務管理科。承擔行政、政法、教育體育、文化廣電旅游等部門的預算編審、財政監督、財務管理、績效管理、政府采購、資產管理、信息公開、非稅收入組織及相關專項資金收支等財政管理工作，研究提出相關財政政策；貫徹執行國家政法經費保障政策制度，擬訂地方配套政策并組織實施；研究制定財政支持教育體育文化廣電旅游事業改革與發展的政策，提出優化事業支出結構的建議；擬訂行政事業性經費的財務管理制度；制定需要統一規定的開支標準和支出政策；牽頭行政事業單位“三公”經費管理；管理有關罰沒收入等。
(五)社會保障科。承擔區人力資源和社會保障、民政、衛生健康、退役軍人事務、醫療保障、殘聯、紅十字會等系統和部門的預算編審、財政監督、財務管理、績效管理、政府采購、資產管理、信息公開、非稅收入組織及相關專項資金收支等財政管理工作；研究提出完善有關社會保障的財政政策和財務管理制度的建議，承擔有關社會救助、社會福利、退役軍人事務、醫療衛生、計劃生育、勞動就業、社會保障基金、被征地農民及殘疾人事業等民生資金的保障和相應的監管工作；審核和匯總全區社會保險基金預決算；參與養老保險基金和職業年金的委托投資運營工作。
(六)國庫科。執行國家金庫管理制度和財政總預算會計制度，按時匯總上報全區財政收支旬月報，負責編審匯總全區財政總決算；負責區級部門預算執行，根據部門預算做好財政授權支付額度下達、審核辦理財政直接支付業務工作；做好區級財政性資金保值增值工作，確保財政資金安全運行；負責行政事業單位賬戶管理和財政非稅票據管理工作；負責鎮級收入統計分析以及區鎮財力結算工作，負責非稅專戶和專項資金賬套會計核算工作；牽頭負責部門決算匯編、批復及公開工作；研究推進國庫集中收付制度改革工作；負責與財政審計有關工作。
(七)經濟建設科。承擔區交通運輸、住建建設、自然資源、城市管理、生態環境等部門的預算編審、財務管理、績效管理、政府采購、資產管理、預算公開、非稅收入組織、相關專項資金收支等財政管理工作；負責擬訂本級基本建設財務管理制度；參與會商擬訂政府投資項目管理的有關政策；參與有關部門對政府投資建設項目進行方案論證及可行性研究和效益分析，提出項目經費預算安排的建議；負責城市維護建設資金(包括基礎設施配套費、污水處理費等) 、生態環境保護專項資金的年度預算、決算審核匯總上報工作，牽頭制定專項資金管理辦法；負責石油價格補貼等專項資金的管理；編制國有建設單位基本建設年報；負責國有土地出讓金收支、基礎設施配套費及住房基金管理工作。
(八)工貿發展科。承擔區發展改革、地方金融、科技、商務、市場監管、安全監督等部門的預算編審、財政監督、財務管理、績效管理、政府采購、資產管理、信息公開、非稅收入組織及相關專項資金收支等財政管理工作；參與研究產業政策和企業改革政策；負責財政對企業的專項補助、科技創新、現代服務業、商務發展、人才引進、金融扶持產業發展等專項資金的有關管理工作；負責地方金融企業的財務、資產的監管工作；負責全區農業保險資金管理和監督工作。
(九) 行政事業國有資產管理科。貫徹執行國家、省、市有關行政事業單位國有資產管理的法律、法規和政策；擬訂區級行政事業單位國有資產管理辦法并組織實施；盤活、處置區級行政事業單位閑置資產；牽頭組織資產清查，編制政府資產報告、行政事業單位資產年報和資產月報工作；負責區直行政事業單位資產處置的日常審核、審批；負責區級行政事業單位國有資產出租出借的審批。擬訂區級行政事業單位資產配置標準；建立和完善國有資產管理信息系統；負責區級行政事業單位國有資產評估工作的監督管理。
(十)農業財務管理科。承擔區農業農村、水利、氣象等部門的預算編審、財政監督、財務管理、績效管理、政府采購、資產管理、信息公開、非稅收入組織及相關專項資金收支等財政管理工作；貫徹落實國家財政支農政策，負責財政支農、水利專項資金管理，擬定資金管理辦法，研究提出本級支農、水利資金預算安排的建議，協助有關部門進行項目可行性研究論證和效益分析，監督項目實施中資金的使用管理。負責三峽移民后期扶持資金的使用管理。
(十一)基層財政管理科。牽頭擬定基層財政管理制度；組織編審基層財政季報、年報；落實支農惠農政策，參與農村綜合改革，編審基層財政綜改報表；管理村級轉移支付資金；對基層財政資金實施就近就地監管；推進基層財政規范化、精細化建設工作。
(十二)債務管理科。擬定全區政府債務管理的政策措施并組織實施，承擔政府債務余額管理和預算管理工作；承擔政府債務風險預警管理；做好地方政府債券轉貸、還本付息工作；承擔全區政府隱性債務管理相關工作。
(十三)績效管理科。研究建立全方位、全過程、全覆蓋的預算績效管理體系；擬訂預算績效管理政策、制度和實施辦法；組織開展區級財政資金預算績效目標管理、績效運行控制、績效評價等工作；組織和指導區級部門(單位)開展預算績效管理工作；指導鎮（街道）開展預算績效管理工作。
(十四)會計管理科（行政服務科）。依法管理全區會計工作；貫徹執行國家統一的會計準則等規章制度；負責全區會計法規制度的宣傳貫徹工作；負責全區會計專業技術資格考試、評審和管理工作；組織、管理會計人員的業務培訓和繼續教育；指導和推廣實施會計信息化標準；負責全區代理記賬機構設立審批，管理和監督檢查代理記賬機構和代理記賬行為；負責局行政審批的組織、協調、跟蹤、督促；負責區直行政事業單位內部控制管理工作；負責區、鎮會計檔案管理指導工作；牽頭負責會計學會、珠算協會日常管理工作。
(十五)財政監督科。組織實施財政監督工作，建立健全“大監督”機制；承擔財稅法律法規、規章及政策執行情況、預算管理有關監督工作，提出加強財政管理的政策建議；承擔會計信息質量監督工作；負責財政系統內部審計工作。
(十六)政府采購管理科。負責擬訂政府采購管理辦法；研究提出政府采購預算管理政策；管理和監督政府采購活動；組織政府采購人員培訓；處理政府采購中的投訴事宜；協助上級機關管理政府采購評審專家庫；對政府采購集中代理機構實施監督檢查。
機關黨委。負責機關及所屬事業單位的黨群工作。