南通市通州衛生職工中等專業學校
主要職責為承擔負責全日制中等職業醫藥衛生人才教育培養；負責全區各級各類衛技人員提高學歷繼續教育及各類培訓；負責全區各級衛生單位領導干部培訓提高；負責區直醫療衛生單位黨員培訓。負責協助、配合區衛生學會辦公室開展全區衛生系統學術活動等。學校教職工按義務教育學校績效工資標準享受績效工資。
南通市通州區疾病預防控制中心
主要職責為承擔研究并提出急慢性傳染病、慢性非傳染性疾病、地方病、寄生蟲病、職業病等疾病的預防控制規劃，制定疾病控制技術方案和對策措施并負責具體組織實施；負責疾病預防、監測與控制信息的采集整理、統計分析、綜合評價及疫情報告；開展人群健康監測、疾病的流行病學調查，承擔疾病預防、疫點控制、疫區消毒及控制效果評價；負責實施轄區免疫規劃，組織和指導預防接種工作，負責生物制品及冷鏈系統的管理，開展疫苗應用效果的監測和評價、以及免疫活動相關突發事件的調查與處理；開展疾病控制相關技術的科學研究、培訓、咨詢和指導；開展保障人群健康的相關衛生監測、預防及研究，控制健康危害因素；開展公眾的健康教育、健康促進和疾病預防指導活動；指導和參與社區衛生技術服務和初級衛生保健工作；通過衛生行政部門的考核認證，承擔預防性健康檢查工作及健康相關產品的衛生質量檢驗、公證，涉及公共衛生相關場所的衛生學評價；參與對傳染病疫情、污染、中毒等衛生突發事件的調查處理、應急控制和救災防病工作；負責全市皮膚病防治工作的業務指導、皮膚病門診以及特色醫療服務項目的統一管理；承擔同級衛生行政部門和上級疾病預防控制機構交辦的其他任務等。為公共衛生單位。
南通市通州區衛生監督所
《2003年市衛生局市屬事業單位改革方案》明確為行政管理型事業單位，主要職責為承擔衛生行政許可、資格認證的申請受理、預防性衛生審查、現場衛生學審查，提出審核意見并上報；負責有關衛生許可與資格認證有關證書的發證、注冊、核驗等事務工作；依法對管理相對人進行經常性衛生監督；承擔現場衛生監測、抽樣檢查等工作；實施對食品衛生、飲用水衛生、化妝品衛生、公共場所衛生、職業衛生、學校衛生、放射防護、消毒殺蟲產品的衛生監督；實施對醫療機構、采供血機構及衛生專業人員的執業許可與監督管理；實施母嬰保健、傳染病防治監督；對違反法律、法規的行為提出立案報告、進行調查取證、提出處罰建議，送達并執行決定；參與對危害公共衛生的污染、中毒、傳染病疫情等衛生突發事件的調查處理、應急控制和救災防病工作；受理有關投訴、舉報并進行調查；開展法制與公共衛生知識宣教與咨詢，負責培訓衛生監督員，做好信息資料整理、匯總分析、評估報告；承擔同級衛生行政部門和上級衛生監督機構交辦的其他任務等。其中：公共場所衛生監督職能，國務院1987年《公共場所衛生管理條例》第十條：各級衛生防疫機構，負責管轄范圍內的公共場所衛生監督工作。
南通市通州區婦幼保健計劃生育服務中心
（1）區婦幼保健計劃生育服務中心的主要職責為：承擔轄區內婦女保健、兒童保健、孕前和孕產期保健、婚前醫學檢查、產前篩查（診斷）、新生兒疾病篩查、計劃生育技術服務、信息咨詢、避孕藥具管理與不良反應監測和出生缺陷綜合防治等公共衛生服務以及婦女兒童常見疾病防治等臨床醫療服務；開展轄區內婦女兒童健康狀況及影響因素調查，提出健康促進計劃的建議，并負責婦幼健康信息管理、服務質量監測、技術培訓和適宜技術推廣等工作；受行政主管部門委托，對下級機構的業務指導與評價，并做好轄區婦幼健康服務工作檢查、考核與評價等；承擔母嬰保健相關法律證件管理、婦幼重大公共衛生服務項目管理。（2）鎮（街道）婦幼保健計劃生育服務站主要職責為：承擔轄區內婦女保健、兒童保健、孕前和孕產期保健服務以及婦女兒童常見病防治等臨床醫療服務；承擔計劃生育技術服務、優生指導、藥具發放、隨訪服務等任務；落實基本公共衛生服務項目，協助開展婦幼重大公共衛生服務項目；協助采集相關信息，做好流動人口計劃生育相關服務工作；負責對村（居）計生專干和婦幼保健人員提供業務培訓指導；具有母嬰保健專項技術執業許可（助產、計劃生育）的衛生院（社區衛生服務中心）承擔相應的助產技術服務和計劃生育技術服務。
南通市中心血站通州分站
主要職責為承擔配合區獻血辦公室統一管理本轄區血液，做好無償獻血的宣傳教育、計劃調度、聯系發動和組織實施工作；做好采血、供血工作，為轄區內的各級醫療機構提供臨床用血和應急用血；根據衛生部有關規定，做血液檢測、質量控制，保證血液質量，保障供血者和受血者的安全、健康；開展成分血制備，并指導臨床成分血的應用；培養輸血技術人才，開展輸血科研、教學工作，進行學術和科技交流等。為公共衛生單位。
南通市通州區初級衛生保健委員會辦公室
主要職責為承擔實施初級衛生保健規劃，負責全市初級衛生保健工作的組織協調和檢查指導；負責村級醫療機構監督與管理；負責鄉村醫生隊伍管理；指導開展農村社區衛生服務工作等。為衛生局機關行使職能提供支持保障。
南通市通州區醫藥衛生學會辦公室
主要職責為承擔市醫學會、中醫學會、護理學會、預防醫學會、藥學會學會事務管理工作；組織各學會的學術交流、學術論文的征集、匯編，參加上級組織的優秀論文評選活動；組織各學會的學術講座、業務培訓等。配合好上級學會在本區舉辦的各種學術講座、學術年會等活動；組織醫療科研活動并做好服務工作；在區科協的領導下組織做好科普宣傳、醫學咨詢、義診等活動；配合其他單位做好醫務人員的繼續教育工作；配合上級學會做好醫療事故鑒定的有關工作等。為衛生局機關行使職能提供支持保障。
南通市通州區人才服務中心衛生分中心
主要職責為承擔受區人才服務中心授權，具體承辦衛生系統內單位和個人的人事代理業務等。為衛生局機關行使職能提供支持保障。
南通市通州區衛生財務服務中心
主要職責為承擔配合做好全區醫療衛生單位財務審計，協助做好全區醫療衛生單位固定資產投入招標投標工作，負責衛生院日常收費的匯總、審核及撥付，參與鎮衛生院年度財務檢查及績效考核等。為衛生局機關行使職能提供支持保障。
通州區“120”急救指揮中心
主要職責為：（1）負責本地“120”呼救電話的受理；承擔全區范圍內的日常院前醫療急救、突發事件的醫療救護和重大活動醫療保障的指揮調度。（2）建立信息共享、功能完備、互連互通的“120”急救醫療指揮調度信息系統，實現省、市、區急救體系聯網運行。（3）研究制定醫療急救應急預案、相關規章制度及各類醫療急救人員的崗位職責。（4）負責對各急救分站的工作指導及考核。（5）負責院前急救工作人員的業務培訓。（6）負責普及急救知識、急救常識和急救宣傳教育。（7）完成區委、區政府和區衛計委交辦的其他工作。
南通市通州區計生協會
（1）協助政府貫徹落實黨和國家的計劃生育法律法規，參與制定和實施人口和計劃生育方案；（2）依法維護育齡群眾在計劃生育和生殖健康方面的合法權益，提高婦女地位、促進實現男女平等；（3）向育齡群眾提供計劃生育、生殖健康的信息和服務，提高育齡群眾生活、生命質量；（4）參與計劃生育的民主管理、民主監督，發揮黨和政府聯系群眾的橋梁和紐帶作用；（5）調查研究，組織培訓，表彰先進，交流經驗；（6）協助衛計委完成人口和計劃生育中心工作。