西亭鎮黨委、政府設下列職能機構：
（一）黨政辦公室（鎮域治理現代化指揮中心、網格化服務管理中心）。主要承擔鎮機關文秘、檔案、保密、政務公開等日常事務職責；負責鎮黨委、政府綜合協調、后勤保障、政務監督等工作；負責鎮域治理現代化指揮平臺和網格化服務管理工作；負責區域范圍內各個領域各類信息資源的匯聚共享、智能搜索、分析研判、監測預警、聯動指揮、行政問效等工作職責。
（二）黨群工作局（黨建工作辦公室）。負責黨的組織建設、黨風廉政建設、機構編制、干部人事、群團建設、招才引智等工作；負責宣傳、統戰、民族宗教和精神文明建設等工作。
（三）政法和社會管理局。負責轄區內社會穩定、社會管理和社會事務等工作；健全基層社會管理體系，指導促進村（社區）和諧建設；負責依法行政工作；協助做好網格化服務管理工作。
（四）經濟發展局。負責優化經濟發展環境，加強項目建設服務；統籌協調招商引資、服務業發展、工業經濟、科技管理等工作；制定實施人才資源發展規劃。
（五）財政局。貫徹執行有關財政法律、法規和財經制度；負責公共財政建設，強化對國有及集體資產的監管工作；承擔審計和其他財政財務管理等工作。
（六）建設局（生態環境辦公室）。負責轄區內自然資源保護利用、城鄉規劃建設、城鄉一體化和鄉村振興建設等工作；承擔生態環境保護等工作。
（七）綜合行政執法局（安全生產監督管理局、綜合行政執法管理辦公室）。負責轄區內綜合行政執法，依法行使相關行政 處罰及與行政處罰相關的行政強制措施權和監督檢查權；負責轄區內安全生產監督及應急管理等工作；協調配合區級相關執法機 構開展聯合執法。
（八）農業農村和社會事業局（退役軍人服務站）。承擔農村改革發展和新農村建設工作；負責“三農”政策執行和海洋漁業生產管理；負責教體文化、衛生健康、食品安全、社會保障、民政、綠化造林、殘疾人保護等社會事業發展；負責退役軍人服務管理工作。
（九）為民服務中心。負責轄區內政務服務日常管理工作，簡化工作流程，規范便民服務，推進“不見面審批（服務）”改革，負責鎮、村（社區）兩級便民服務體系建設；負責公共資源交易管理工作。
按照有關法律、法規和政策規定，設立西亭鎮人大、紀檢監察、工會、共青團、婦聯、人民武裝等組織。建立基層政協聯絡工作機制。